方一藻（1594年—1640年），南直隶歙县人，字子元（又作玄根）。明末官员。
人物生平天启元年（1621年）中举人。天启二年（1622年）在殿试中以二甲二十一名获赐进士出身。观政于户部，同年授户部云南司主事，天启六年（1626年）升户部陕西司员外郎，同年外放保定知府。崇祯二年（1629年）升霸州道副使，崇祯三年（1630年）调永平道，崇祯四年（1631年）改河南副使、遵化道。同年十一月二十九日，升右佥都御史、巡抚宁锦。翌年九月，请在其头衔加辽东字样。崇祯九年（1636年），加兵部右侍郎衔，升右副都御史。崇祯十一年（1638年），升兵部左侍郎衔，兼右都御史。
当时吴三桂“拜其门下”，又与其子方光琛“缔盟为忘形交”。崇祯十一年（1638年），陈新甲主议和，让方一藻赴方盛京（沈阳）与清廷接触。于是方一藻派遣一名“瞽人卖卜者”周元忠到沈阳洽谈，皇太极基本上同意。方一藻建议用隆庆年间“俺答封贡”的模式与对方谈判。为黄道周所排斥，连上三疏。和议之事不了了之。
崇祯十二年（1639年），加兵部尚书衔。翌年回部任职，管左侍郎事。因其所陈对清战守方略得不到执政者的同意，忧郁成疾，辞官回籍。十月二十三日卒于天津。
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